Der dreizehnjährige Nils Holgersson ist ed leid, mit seinen Eltern auf einem Bauernhof zu wohnen. Anstatt auf der Farm zu helfen, spielt er lieber Streiche und neckt Tiere. Er möchte mehr Zeit mit einem schönen Mädchen verbringen - Asa. Eines Tages wird sein Leben unerwartet verändert. Nils trifft einen Elf, der ihn auf seine Größe schrumpfen lässt. Außerdem beginnt Nils, Tiere zu verstehen und mit ihnen zu kommunizieren und Freundschaften zu schließen. Als Martin mit einer Gruppe Gänse, angeführt vom weisen Morgen, nach Lappland fliegt, schließt sich Nils ihnen bereitwillig an. Aka ist zuversichtlich, dass es Nils helfen kann, ein besserer Mensch zu werden und so sein normales Wachstum wiederzugewinnen. Währenddessen reist Asa auch nach Lappland, um Nils zu finden.